横亘于中国南部的南岭山脉是长江水系与珠江水系的分水岭，耸峙于赣闽边境的武夷山脉是赣江与闽江的分水岭，这两大山脉都是中国自然地理上的重要分界线。三百山景区地处武夷山余脉与南岭的九连山余脉绵延交错地带，是中亚热带湿润常绿阔叶林与南亚热带季风常绿阔叶林过渡地带，植物与植被具有过渡带的典型性，生物多样性丰富，是国内外科学家极为关注的地方。

参照《中国植被》和《江西森林》的分类原则和分类单位，采用“群落学一生态学”原则，依据对三百山景区植被的群落种类组成、外貌结构、生活型、建群种类、生态地理特征和动态特征调查统计分析，景区内主要的自然植被可分为4个植被型组，10个植被型，88个植物群系。

三百山景区森林植被分区属 ：Ⅳ中国亚热带常绿阔叶林区域——Ⅳ A 东部（湿润）常绿阔叶林亚区域——Ⅳ Aii 中亚热带常绿阔叶林地带——Ⅳ Aiib 中亚热带常绿阔叶林南部亚地带——Ⅳ Aiib-2 南岭山地丘陵栲、楠、阿丁枫（蕈树）林、松杉林区——Ⅳ Aiia-2（15）九连山山地丘陵栲、楠、半枫荷林、桂杉林亚区（九连山森林亚区）。

影响森林公园植被分布的主要因素为土层厚度，东风湖两侧山体土层厚度较厚，立地条件较好，发育有良好的常绿阔叶林植被，起到良好的水源涵养作用；而公园中北部及东南部部分山地，土层相对瘠薄，石灰岩裸露较多，发育有典型的石灰岩落叶阔叶混交林及藤灌植被。

三百山景区保持着一种原始的山野景象。自然环境古朴、清寂、幽静。登高远眺，只见青山叠翠、林海茫茫，一望无际，令人心驰神往。